重庆市巴南区人民代表大会下设4个专门委员会，分别为区人大监察和法制委员会、区人大财政经济委员会、区人大教育科学文化卫生委员会、区人大社会建设委员会。常务委员会下设1个综合办事机构和4个工作机构，分别为区人大常委会办公室、法制工作委员会（与区人大监察和法制委员会合署办公）、人事代表工作委员会、农业与农村工作委员会、预算工作委员会。龙洲湾、鱼洞、莲花、李家沱、花溪、南泉、一品、南彭、惠民9个人大街道工作委员会为常委会派出机构。